Vesta Control Panel - Forum

А дело было точно в сертификате. Когда просрочен он, апач потом не запускается.
Так же решение проблемы обновление сертификата - временное отключение nginx

В общем, проблема самоустранилась, после свежего обновления Apache и сертификата. В чём же дело было - не ясно.
Но, судя по тому, что время работы Apache меньше, он перезапускался, а тогда просто не мог самостоятельно запуститься, в процессе самоперезагрузки.

А я искал его в своей папке...

В общем, похоже, его ломает Certbot
[Sun Jun 25 00:04:11.403502 2017] [mpm_prefork:notice] [pid 1339] AH00171: Graceful restart requested, doing restart
AH00112: Warning: DocumentRoot [/var/lib/letsencrypt/tls_sni_01_page/] does not exist
AH00558: apache2: Could not ...

Здравствуйте! Пару дней назад на Ubuntu16.04.2 начал выключаться apache , интервал пока 12 часов, примерно. Возможно, это как то связано с недавними обновлениями. Лога ошибок в папке нет. По графикам, перед падением, был рост потребления памяти.