Vesta Control Panel - Forum

Аналогичная ошибка, после обновления не ушла, ребилд конфигов не помог.
Но после переключения обработчика статистики на none, сохранения, включения обратно и снова сохранения - все заработало - может кому поможет. (Ну или парсить конфиги обработчиков и менять там %web_system% на нужное значение).